搅拌是一种应用广泛的单元操作，其原理涉及流体力学、传热、传质、化学反应等多个过程。由于生物发酵搅拌器是一种输送机械能的装置，如何正确选择生物发酵搅拌器成为一个被广泛关注的问题。
化工生产中的各种工艺过程涉及到各种具有不同特性和不同搅拌目的的物料。选用的生物发酵搅拌器不一样，所以工艺流程多种多样，搅拌目的也多种多样。
它可用于各种液体的互溶和混合。选择生物发酵搅拌器需要评估搅拌效果。一般评价搅拌效果的指标需要混合时间来衡量，使用的混合时间越多，选择生物发酵搅拌器越好。
生物发酵搅拌器的选择是设计过程中的关键一步，是一个相当复杂的过程。影响因素不仅很多，而且相互之间相互联系、相互制约。在同一个应用系统中可以使用几个不同的生物发酵搅拌器，以实现混合效果和更好的经济性之间的平衡和折衷。选择一个好的生物发酵搅拌器 是选型的目标。
生物发酵搅拌器的形式和混合特性很大程度上决定了系统的混合效果。因此生物发酵搅拌器的选择直接影响整个搅拌反应器的成本和运行费用。
对于给定的搅拌过程，搅拌装置的选择和设计没有成熟的方法。目前大多靠经验和对放大技术的掌握。生物发酵搅拌器一般选择要保证物料的混合，耗电少，要求成本低，操作方便，易于制造和维护。